
2024年9月由沈阳渔业大家张万刚教受团队图片在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物工程为该研究提供了亚硝基化遮盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
2英文网站标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202四年的影响指数公式:5.7
发稿时长:2024年9月
业主单位名称:南京农业大学
学习的原材料:蛋白
拜谱提拱技能:亚硝基化修饰组学
水平线路:
一、科研然而
01.Caspase-3几丁质酶
现有尚不了解清楚NO对caspase-3的治理和改善帮助可不可以归因于NO介导的S-亚硝基化,各个渗透压梯度方向的GSNO当做外源性NO生产,以介导caspase-3的离体S-亚硝基化。结果显示说明,与也没有GSNO的组比起,100、200和400μM GSNO组的caspase-3催化活性酶更为明显调低(图1),与已经媒体报道一样。GSNO处置调低caspase-3催化活性酶的内在缘由仍亟待阐述。
图1 区别氨水浓度的GSNO工作对caspase-3亲水性的反应
02.Caspase-3的S-亚硝基化系数
研究Caspase-3的亚硝基化层次,以揭示GSNO对Caspase-3的反响性。经GSNO清理后,监测到caspase-3球蛋白S-亚硝基化承载力上升(图2)。以上报告单反映,外源性GSNO培育可获得成功成脂caspase-3的体内S-亚硝基化。最令 震惊的是,在无GSNO的存在的相较比较组中监测到一位较弱的S-亚硝基化带,这反映caspase-3会出现内源性的S-亚硝基化。最后,本研究中caspase-3的S-亚硝基化层次较高,而caspase-3的催化活性大大减少,这与以后的研究不一样。只不过,caspase-3的炎症因子朋友S-亚硝基化呈现位点尚不非常清楚,还都要进一点的研究。
图2 GSNO外理对caspase-3S-亚硝基化水平方向的影向
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化淡化组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。蓝绿色标志图片的队列觉得S-亚硝基化肽,大红色标志图片的C觉得S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3降解塑料结血清
结血清作为一个一些极为首要的神经体细胞骨架血清,在提升肌神经体细胞机构的机构详尽性和收敛性几个方面起着极为首要效果,研究分析S-亚硝基化caspase-3对结血清分解的明单纯兼备极为首要的意义。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的默认肌纤维材料板血清)组相较于,0 μM GSNO组(肌原纤维材料板和caspase-3的孵育,无GSNO)的详尽结血清分子量强势缩减,提示卡caspase-3对结血清兼备不确定性的血清溶解专业能力。在GSNO孵育后,详尽结血清的分子量比较明显增多(P < 0.05)。虽然,当GSNO酸度上升时,详尽结血清的分子量长期调整(P < 0.05)(图5)。相应遇到表述,SNO遮盖的caspase-3以质量依赖关系的的方式阻止结血清的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙蛋白质-T
肌钙蛋清-T (TnT)是原肌球蛋清转换全权负责胸肌膨胀的细条的都要肌原玻璃化学植物纤维蛋清。TnT的挥发共同点是检查测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化因素下,caspase-3对TnT的挥发环境如同6已知,与Std组(含有caspase-3和GSNO的肌原玻璃化学植物纤维)比起来,caspase-3组中30 kDa TnT精彩片断可观提高,说明caspase-3组织了TnT的挥发,虽然,caspase-3与GSNO的孵育促使30 kDa TnT下调。在100和200 μM GSNO组直接还没有检查测量到比较明显的的差异(P > 0.05),而当GSNO的氧浓度满足400 μM 时,该精彩片断可观降(P < 0.05)。哪些出现 说明了SNO体现的caspase-3对TnT挥发的抑制作而成用用处。结蛋清和TnT是caspase-3的神经敏感底物,而GSNO治理 降caspase-3的渗透性酶类有机会促使肌原玻璃化学植物纤维蛋清挥发水平降。上述情况指出,NO诱惑的S-亚硝基化是可以实现体现半胱氨酸残基来转换caspase-3的渗透性酶类,于是进一大步会不良影响其对结蛋清和TnT的蛋清溶解特性,才能会不良影响牛肉片的质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋清-T
二、个人心得体会
本研究研究重在研究S-亚硝基化对caspase-3突显的会印象简述陆陆续续对牛羊肉肌原氯纶体内光降解的会印象。球球蛋白质S-亚硝基化就能够突显caspase-3的半胱氨酸残基,进而诱发caspase-3化学活化降低了,进步骤阻止了其对牛羊肉肌原氯纶球球蛋白质的球球蛋白质电离实力。三、拜谱总结
设计运用了酶活测试,亚硝基化遮盖组学研发分析,WB等检侧方法手段,得知球球球球蛋白S-亚硝基化可以遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,这引起了caspase-3催化活性的降低了,相结十步控制了其对牛羊肉肌原食物纤维球球球球蛋白的球球球球蛋白溶解性能。本设计为解悉球球球球营养素亚硝基化对肉嫩的调节管控规则展示没事个新的移动镜头。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的脂肪酸质组学、绘制脂肪酸质组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸品类成品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total空气氧化展现、矿酸巯基,欢迎大家咨询!
考生文献资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663