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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网络数据药学学呈现草酸钙肾结石钝化应激状态和宫颈炎症挫裂伤工作机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿装置最经典型的的疾病之1。肾组识中CaOx尖晶石过过饱和沉淀会引发肾小管上皮细胞伤到和凋亡,以此引发肾结石的行成。短链肌肉酸由肠胃内厌氧发孝微生物发孝饮食纤维素诞生,不仅仅在轮廓线肠胃防御装置中激发出来帮助,而在装置技术水平上也激发出来重要性帮助。另外,丁酸是最雄厚的短链肌肉酸,具抗感染和免役促使帮助,本论述论述丁酸对CaOx肾结石的帮助试述因素靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院科室泌尿整形外科吴忠教受、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健硕士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了手机网络药理学学服务项目,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

的文章各称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 用户机构:华山专科医院 钻研相亲对象:大鼠、HK-2神经细胞 分类问题:相较比较组(Con)、3d模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提高枝术:网咯药学学加测

想法程序图

理论研究最终

科学探讨工人一开始在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠实体建模 ,确认生活生化模式指数公式和策划 病理学学复染等科学探讨有效途径表明丁酸需要极大减少CaOx实体建模 大鼠肾CaOx结晶的型成和拉伤,促进CaOx实体建模 大鼠的疾病拉伤和空气空气氧化杂质的太过展现。除外,丁酸还能抑制作用草酸促进的HK-2肿瘤内部拉伤、空气空气氧化应激反应和肿瘤内部凋亡。 为探索丁酸框架和靶染色体组组无线网洛,深入阐述员工从PubChem获利丁酸和丁酸酯的二维和三维立体框架(图1A)。依据PharmMapper的动态数据资料库和Uniprot的动态数据资料库做出处理后共淘汰出117个丁酸靶染色体组组供进一部阐述。将染色体组组列表页拷贝到STRING的动态数据资料库,做出PPI无线网洛阐述。Cytoscape得到了重新排列的前20的核心靶染色体组组的详解无线网洛图,属于CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这核心染色体组组与无线网洛中的各种染色体组组均突出表现出务必的涉及性,详细说明这染色体组组将会发挥出来模块着融合模块。GO和KEGG阐述揭露了丁酸核心染色体组组的涉及行业和生态学学模块(图1C)。核心染色体组组通常与类固醇雌性激素回应、脱色应激状态性回应、特异性氧氧组织细胞对类固醇雌性激素畅快的表现包括对强酸有机化学物的表现有观。上面所写,这核心染色体组组通常通过了脱色应激状态性和对特异性氧氧的生态学表现具体步骤,是肾结石确立制度化中至关关键性的行业,这显示丁酸将会在肾结石中发挥出来模块关键性模块。

图1| 丁酸结构设计与靶染色体网站分析一下(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一歩科学探索丁酸对CaOx肾结石肯定切靶遗传人类染色体遗传遗传遗传,论述职工利用率GEO数据报告源库对GSE73680中健康生活对应与CaOx肾结石病人的遗传人类染色体遗传遗传遗传距离开展了论述。对应组与CaOx结石病人的更为明显性距离表现遗传人类染色体遗传遗传遗传(DEGs)检测标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个遗传人类染色体遗传遗传遗传发生更为明显变幻,至少3379个(89.4%)遗传人类染色体遗传遗传遗传表现上浮,404个(10.6%)遗传人类染色体遗传遗传遗传表现下跌(图2A)。对DEGs开展聚类分析算法剖析,热图显视了前10个被选中DEGs的二维分类聚类分析算法共同点(图2B)。接着随后,论述职工用GeneCards数据报告源库人工客服电话判定了370个也许与CaOx肾结石有关系的遗传人类染色体遗传遗传遗传,自然排名前20位的预估遗传人类染色体遗传遗传遗传以至于有关系性计分如图是2C如图是。成了找丁酸治疗方法CaOx肾结石的关键的靶点,论述职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系遗传人类染色体遗传遗传遗传治理 能够没事个Venn图。最中,CYP2C9被确保为丁酸印象CaOx肾结石的隐性靶点(图2D)。凡此种种,论述职工还开展了丁酸与CYP2C9的原子项目对接,CYP2C9的以下三个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此之间能力,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在巧用在线药学学預测CYP2C9是丁酸不良影响CaOx肾结石的靶基因遗传后,分析人群还实现上皮细胞膜研究可确认了CYP2C9可降草酸引发的HK-2上皮细胞膜的ROS层次、慢性炎症影响和凋亡。

图2| 半数以上据库联和研究分析予测CYP2C9是丁酸意义于CaOx肾结石的靶基因遗传

的研究结论

本设计第一方面发展丁酸在离体和内部均能治理和改善CaOx肾结石模特的空气防氧化应激状态状态和宫颈发炎软组织直接磨损,陆陆续续经过无线数据网络药剂学学筛分受到丁酸决定CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9,另外经过组织检测证明CYP2C9在草酸盐引诱的HK-2组织ROS含量、宫颈发炎软组织直接磨损和凋亡。等发展证实丁酸也许经过治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的空气防氧化应激状态状态,减小宫颈发炎软组织直接磨损。这一个操作过程中拜谱海洋生物制品展示 了无线数据网络药剂学学的技术工艺服務,还有就是拜谱海洋生物制品可增强成长落实的基因遗传组学、蛋清质组学、代谢率组学等多个学类产品及的技术工艺服務,欢迎图片拨通咨讯! 参考资料资料:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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