
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC下列不属于配合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫性肽编码序列各种译为后淡化问题,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序系统,不依赖现有数据库,高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰厚的统计数据解析內容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肿癌抗原的行业
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案例阐述阐述
01 管理机制的研究
本文题目的:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
刊出月刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)一种核打印输出蛋清,在恶性肿癌中通常过形容,做以为肿癌出现的动力问题。迄今为止,靶向治疗XPO1的小分子式正被用做临床检验治癌中药。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫系统肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一个出自XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 恶性肿瘤-免疫力缓解
好文章一个题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
发表过杂志网站:Nature Communications IF:16.6 2023
恶变胸膜间皮瘤(MPM)一种生存率不合理的入侵性良性肿瘤。会因为现今的冶疗设计欠缺见效,故此十分困难需用新的冶疗思路。基于其T组织浸润性,我猜测MPM一个刚好合适的冶疗性癌症复发接种疫苗的制定目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用源于质谱的免役肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤抗体肽组学探测
03 病毒mRNA预防针开放
小文章大题目:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发表论文月刊:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过针对质谱的免疫性肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌交叉感染的Hela体神经元和HCT-116体神经元中评定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
免役力系统检测力装置肽组学是淀粉酶质组学的同一个加快经济发展的支系,它悉心于学习免役力系统检测力装置装置中由主耍组织化机构混溶性挽回体(MHC)或人类白细泡核抗原(HLA)原子呈递的免役力系统检测力装置肽。这种免役力系统检测力装置肽是组织化血生殖癌细胞核漆层呈递的肽段,还可以被T组织化血生殖癌细胞核快速精确,导致触及免役力系统检测力装置不良反应。为质谱的免役力系统检测力装置肽组学早已成為检验MHC淀粉酶呈递肽的金标准的办法,还可以一直检验区别身体和病检的情形下区别组织化机构和组织化血生殖癌细胞核分类中的免役力系统检测力装置肽组,如实物瘤或类病毒细菌感染的组织化血生殖癌细胞核。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫的检测肽组的测试服务质量,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,才可以准确的且会提供数据天然免疫细胞肽字段,出现更高非常见天然免疫细胞肽,自上而下筛分出靠得住新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
基准论文文献综述
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y