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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

时不时做化工类配料而被认识的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“产生危化物”变成 “宝库小原子核”的辛酸史艰辛一样,终会近10多年才被显示其注重的生物技术学特点,就此“坐起农奴把独唱”,相当是在免疫系统感染性的肠道疾病论述方面内与时共进。以有几篇职称论文通讯报道了在各式各样感染性的肠道疾病的爬行动物模特中寄予衣康酸或其化学工业呈现延伸物技术的根治益处,并显示其隐性靶点。管于衣康酸的“前世姻缘”与“今身”,具体情况见文章《乳酸的学渣逆袭兄弟姐妹——衣康酸!这课和你一起知晓衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸表达核蛋白组学产品,实现1000+举重若轻度遮盖位点排除,维持重演特色靶点,全多方面生信进行分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉”到“证实”全注意事项功能,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验室流程图

02、测试数据显示数据显示

03、经“点”初现

在场地实测信息中,检测出各个论文参考文献中报道怎么写的特别靶点简答衣康酸淡化位点,如首个个被找到的衣康酸共价淡化血清KEAP1,、糖酵解径路中的3个最为关键的点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,、炎性小体成分血清NLRP3和细胞膜萎缩整个过程中的最为关键的点血清RIPK3等,其质谱图给出图如下。

04、企业产品特殊性

1.很多质控

金融业化特异形电极孵育、SDS-PAGE测试、WB证实、样品相应性具体分析等各种位测试,确保安全新项目结局准确性。

2.高功效质谱医疗仪器服务平台

在Orbitrap Astral全新这一代高辨别质谱仪六道金刚咒下,实现目标衣康酸性反应装饰位点及球蛋白检测新的深度,助推科学实验调查新遇到。

3.全的流程站台式售后服务

针对拜谱生物体进一步优化的实验操作手机平台,可提高“体细胞培养计划→验测器孵育→WB验测→什么难以理解的度衣康硝化作用修饰语验测→专有生信解析→某些位点PRM核验”全工作流程安全服务,省时省功更又省心。

05、定量分析内部(的部分)

06、应该用朝向

PART 2、专著共享

文章一

英语关键词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

2英文网站标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

理论研究网站内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文参考文献二

日文一级标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

简体中文名称:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

分析信息:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物发展指导思想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13更具良好的底物构建性能,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康过酸修饰语组测试统计数据统计数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应体现(下述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

当做TCA循环法中的中心细胞分泌转化物,衣康酸调试细胞分泌转化、免疫检测力细胞和真菌感染当中的完美功用,为治愈免疫检测力细胞真菌感染性皮肤急病能展示了重复使用治愈对策。衣康酸节构特征中的亲电性α,β-不饱和羧酸节构特征能对淀粉酶质上的亲水性半胱氨酸残基实现烷基化淡化(迈克尔加强想法),该翻意后淡化被称是“衣康酸淡化(itaconation)”,行而引响淀粉酶质功能性,管控免疫检测力细胞初次应答和细胞分泌转化途经,为多种不同皮肤急病药物治疗研发部能展示新理念。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸绘制淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物药学千万参考值靶向治疗基础代谢组(QMT1000)或激光能量细胞产生靶点细胞产生组厂品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考使用专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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